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雑談スレ　その215
東大二号館
小保方博士のアメリカ行きを阻止するスレ
☆★★ＤＮＡの問題解いてみやがれ★★★★
STAP細胞の懐疑点PART941
STAP細胞の懐疑点PART1026
音楽を流せるスイッチがあれば動物は任意で押すか？
まだ理研が隠している重大な秘密があるらしいね
【逃げ切ったぞ！】若山くん９【山形大】
天才チンパンジー「アイちゃん」はいまぁ～～す
844 ：
>>789が考えるとことによると
>>723の後半の例（"The evolutionary origin of complex features". Nature 423 (6936): 139-44）
は
『【生物】の進化じゃなくて【コンピュータプログラム】の進化をシミュレートしてるだけ』
つまりこれは進化の検証にならないと言いたいんだと思う
（※まあそれだけじゃ「進化の総合説が科学的に検証できる」に対する反論にはなってないというのは>>842に書いてあるとおり）
とりあえず、仮に完全に現存の生物をシミュレートした物だとしても
コンピュータ上で動く【コンピュータプログラム】なので、
【コンピュータプログラム】を強調しても的外れだね
ではここから本題だ
>>789が引用した文章をもう一度読んでみよう
和訳はできているだろうけど、意味を考えてみてね
A long-standing challenge to evolutionary theory has been whether it can explain the origin of complex organismal features.
We examined this issue using digital organisms―computer programs that self-replicate, mutate, compete and evolve.
一応和訳ね
進化理論の長年の問題は、【生物の(organismal)】複雑な機能の起源を、それ（進化理論）が説明できるのかどうか、だった。
我々は、【この問題を】デジタル生物―自己複製し、突然変異し、競争し、進化するコンピュータプログラム―を用いて調査した。
生物の複雑な機能が、遺伝的浮動と突然変異と自然選択みたいな現在の進化理論だけで説明できるのだろうか
という問題を検証するために
デジタル生物（生物と同じように自己複製・突然変異・競争するコンピュータプログラム）
を使ってシミュレーションしたわけだね
>>789はこれが生物の進化についての理論をを検証するのに不十分だと思っているようだけれども
この、現存する生物を完全にシミュレートしていないでないコンピュータプログラムによるシミュレーションが、
【生物の進化理論についての有効な検証として判断された】から論文として載ったわけだね、Natureに
次に続く

845 ：
>>844の続き
>>789は
バクテリアの中での化学反応を完全にシミュレートするのさえ最近ようやくできた程度なのに、
それを考慮していない“不完全な”シミュレーションが
進化理論の検証になることがおかしい、と思うかもしれない
だが、そんなことはないんだよね
ここで進化理論以外の例で考えてみようか
例えば、月の起源についての仮説の検証だ
月の起源としてジャイアントインパクト説があるが、
ジャイアントインパクトのような現象が起こったときに本当に月のような天体ができるということが、
「シミュレーションによって検証された」と言われているわけだが、
このシミュレーションによる検証では
破片が相互に及ぼしあう重力的影響を考慮しているのみ（のみ、と言っても膨大な計算だが）であって、
それらの破片を構成する電子の軌道をシミュレートしてるわけでもなければ、
それらの破片中で起こっている化学反応をシミュレートしているわけでもない
>>789と同じ理屈で考えると
「これは実際の破片でないものをシミュレートしただけ」「破片の中の電子や量子までシミュレートしてないじゃないか」
ってことになるけど、だからといって科学的な検証じゃないかって言ったらそんなことはないよね？
生物の進化シミュレーションと細胞の中の化学反応のシミュレーションも
これに近い関係に当たる
さらに補足するなら、細胞内のDNAからRNAへの転写、mRNAの修飾、そしてタンパクへの翻訳と
タンパクの修飾と機能発現、そうした化学反応がどうであろうと、
その中の遺伝する要素が変化した場合に現れるのは形態や機能の変化（もしくは変化しない）、
そして最終的にはその繁殖効率の変化というパラメータに集約される
そして進化の要因と考えられ、進化をもたらすと思われる部分はそこなわけだ
もう少し補足しても良いけどめんどくさくなってきたからとりあえずここまで

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