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- 680 ：
- calc.FPR = function(nsamp,pval,sigma,prior,delta1){
# sdiff=sqrt(sigma^2/nsamp + sigma^2/nsamp)
ns1=nsamp
ns2=nsamp
# CALC sdiff = sd of difference between means
sdiff=sqrt(sigma^2/ns1 + sigma^2/ns2)
df=ns1+ns2-2
# Note FPR doesn't need calculation of power for p-equals case
#
#under H0, use central t distribution
tcrit=qt((1-pval/2),df,ncp=0)
x0=tcrit
y0=dt(x0,df,0)
#
# under H1 use non-central t distribution
ncp1=delta1/sdiff #non-centrality paramater
x1=x0 #tcrit
y1=dt(x1,df,ncp=ncp1)
# check solution
# pcheck=pt(y1,df,ncp=ncp1)
# pcheck
# Calc false positive risk
p0=2*y0
p1=y1
FPR=((1-prior)*p0)/(((1-prior)*p0) + prior*p1)
cat('FPR = ',FPR,'\n')
output=c(FPR,x0,y0,x1,y1)
invisible(output)
}
# end of function calc.FPR
#
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